Sa faune est elle aussi parmi les plus riches d'Europe : parmi les mammifères, citons entre autres le loup, le bouquetin, le lynx pardelle, diverses espèces nocturnes telles que la genette, le sanglier, le blaireau... Gibraltar est célèbre pour sa colonie de magots, ou macaques de Barbarie, les seuls singes sauvages d'Europe.